物理治療師可以為患有神經肌肉疾病的兒童或成人提供康復治療手段。物理治療師會按個別病人的需要進行肌肉功能的訓練，目標是改善功能和日常生活的自理。

治療內容包括：

• 拉伸運動以增加或者維持上肢、下肢與身體的活動度。
• 提供夾板、矯形器、坐位設備、站位元設備等，以增加或者維持上肢、下肢與身體的活動度，改善日常功能，如坐姿和站立。假如身體情況允許，鼓勵直立的姿勢以改善呼吸功能。
• 提供亞極量有氧運動或者活動，以及水中運動 (如在溫水中運動)，以增加或者維持上肢、下肢與軀幹的肌肉力量和柔韌性。
• 通過利用無創或微創的輔助通氣設備，來幫助患有神經肌肉疾病的兒童和成人維持他們的呼吸功能，清除呼吸道分泌物和預防呼吸道感染。教導家人成員或照料人員如何正確地在家使用呼吸設備。
• 提供輔助設備以提升他們的活動功能，包括拐杖、助行架、滑輪車、手動或者自動的輪椅。
• 家訪或學校訪問來協助支援家長在家裡和老師在學校內如何在日常生活裡照顧這些患有神經肌肉疾病的兒童和青年，並提供建議如何促進學生在校內參與適當的活動。